《自然》发表中科院关于基因编辑技术RNA脱靶及其优化的研究成果( 二 )

《自然》发表中科院关于基因编辑技术RNA脱靶及其优化的研究成果

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杨辉团队今年3月在《科学》杂志报道单碱基编辑技术BE3存在全基因组范围内的脱靶 , 引起了广泛的关注 , 已有的研究对于基因编辑工具的脱靶检测都瞄准在DNA水平 。 而杨辉团队这次将DNA编辑工具脱靶的检测范围扩展到RNA水平 , 首次证明常用的三种单碱基编辑技术均存在大量的RNA脱靶 , 通过精巧的实验设计证明了RNA脱靶主要是由于融合在Cas9上的脱氨酶导致 。 并且发现被寄予厚望的ABE7.10存在大量的RNA脱靶 , 并高频率地发生在癌基因和抑癌基因上 。

通过对混合细胞和单细胞水平的RNA突变位点进行分析 , 该团队发现RNA突变位点和目的靶向序列没有相关性 , 是由脱氨酶产生的随机脱靶位点 。 因此 , 此前已经被应用到多种疾病模型上成功纠正遗传突变的单碱基编辑工具存在无法预测的RNA脱靶 , 有较大的致癌风险 。

《自然》发表中科院关于基因编辑技术RNA脱靶及其优化的研究成果

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为了获得更加精准的单碱基编辑工具 , 杨辉研究组团队对单碱基编辑的胞嘧啶脱氨酶和腺嘌呤脱氨酶分别进行了突变优化 , 最终获得能够完全消除RNA脱靶并且维持DNA编辑活性的高精度单碱基编辑工具 。 除此之外 , 杨辉团队开发的ABE(F148A)突变体还能够缩小编辑窗口 , 实现更加精准的DNA编辑 。 该技术在特异性和精确性上超越了ABE7.10 , 有望在未来成为一种更加安全、更加精准的基因编辑工具 , 应用于临床治疗中 。


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