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国际病毒分类委员会:新冠正式命名为SARS-Cov-2 ..

国际病毒分类委员会:新冠病毒正式命名为：SARS-Cov-2 2020-02-12 13:46:04 来源: 网易公开课 国际病毒分类委员会的冠状病毒研究小组（CSG）在生命科学论文预印本平台上发布了关于新型冠状病毒命名的最新论文 ， 正式将新型冠状病毒从“2019-nCov”更名为“SARS-CoV-2" 。 在国际范围内 ， 病毒的命名由国际病毒分类委员会负责 ， 而疾病的命名由世界卫生组织进行 ， 在这篇论文发布的前两个小时 ， 世界卫生组织将其正式命名为“COVID-19” ， “Co”代表“冠状”（Corona） ， “Vi”为“病毒”（Virus） ， “D”为“疾病”（Disease） ， 而19代表为这一疾病最初的病例是在2019年发生的 。 而在CSG的论文当中 ， 则详细公开了他们对新病毒的命名规则和命名的讨论过程 ， 根据论文的说法 ， SARS-CoV-2这个新名字 ， 将增进对新冠病毒与宿主之间相互作用的理解 。 CSG通过评估新病毒与同一宿主向前已知病毒的相关程度 ， 认为新型冠状病毒与SARS并不是同一种病毒 ， 两者有明显区别 ， 与SARS病毒属于同一类型的病毒 。 这一病毒有其新颖性 ， 也与SARS病毒具有亲缘性 ， 根据官方分类和冠状病毒科的分类命名方法 ， CSG正式承认该病毒为与严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒(SARS-CoVs)的姊妹病毒 ， 并将其指定为严重急性呼吸综合征冠状病毒2型 (SARS-CoV-2) 。

国际病毒分类委员会:新冠正式命名为SARS-Cov-2 ..

为了推动通讯和研究更加统一 ， CSG 还建议对单独的新冠病毒隔离株使用以下命名：SARS-CoV-2 /隔离株/宿主/日期/位置 。 论文全文2019年12月在亚洲出现的人类冠状病毒是否为全新病毒？传染病的爆发是由新病毒还是先前已知的病毒引起的？这是第一个也是主要的问题之一 ， 因为答案会提供措施来检测病原体 ， 控制其传播并限制该流行病的潜在后果 。 它还对病毒名称有影响 。 在不同的时间范围内 ， 答案还有助于确定病毒学和公共卫生领域的研究重点 。 病毒新颖性和命名问题现在都与引起呼吸综合征爆发的冠状病毒联系了起来 ， 该冠状病毒于2019年12月在中国武汉首次发现 。 它暂时被命名为2019年新型冠状病毒（2019 novel coronavirus） ， 即2019-nCoV 。 术语“新型”（novel）可能是指由这种特定病毒感染的人类所引起的疾病（或临床表现范围） ， 而这种疾病只是正在出现 ， 需要进一步研究 。 “2019-nCoV”的术语“新型”也可能表示该基因组与其他（先前已知）冠状病毒的基因组之间的不完全匹配 ， 如果后者也被当做定义“新型”的适当标准的话 。 但是 ， 病毒学家一致认为 ， 疾病和宿主范围都不能用于可靠地确定病毒的新颖性（或同一性） ， 因为很少的基因组变化就可以减弱致命的病毒或引起宿主转换 。 同样 ， 我们知道RNA病毒作为共同进化的紧密相关实体（定义序列的变异 ， 单倍型）的群体而存在 ， 被称为准物种 。 他们的基因组序列是体内不断发展的合作种群的共识快照 ， 可能在一个感染者内随病情的发生而变化 。 如果将严格的新颖性匹配标准应用于RNA病毒 ， 则它可以将具有测序基因组的每种病毒都限定为新颖病毒 ， 这使得该标准难以提供有效的信息 。 为了解决潜在的问题 ， 病毒学家可以将两种具有不同但相似的基因组序列的病毒视为同一病毒的变体 。 这立即引起了一个问题 ， 即有多少差异足以识别候选病毒是新的或是独特的？最佳的方法是 ， 可以通过评估候选病毒与同一宿主的先前已知病毒的相关性 ， 或是建立单系群病毒组 ， 通常称为基因型或进化枝 ， 可能包括或不包括不同宿主的病毒 。 这是在病毒分类学框架中正式解决的（专栏2） 。 在此研究中 ， 我们提出了对2019-nCoV新颖性的评估 ， 并详细说明了（重）命名该病毒严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的基础 ， 此后将使用该名字 。 在冠状病毒家族的分类学中定义SARS-CoV-2的新颖性和位置在21世纪 ， 研究冠状病毒（一种脊椎动物的包膜正链RNA病毒家8）的研究人员多次遇到了冠状病毒新颖性的问题 ， 其中两次是从人畜共患病的库中将严重甚至威胁生命的疾病引入人类的：即严重急性呼吸系统综合症（SARS）的发生 ， 以及几年后中东呼吸系统综合症（MERS）的发生 。 每次通过基于基因序列的家族分类解决问题时 ， 每次都将病原体最初称为新的人类冠状病毒 ， 就像本次爆发期间的SARS-CoV-2一样 。 当前的冠状病毒分类标准包括15个可用等级中的8个分类单元 ， 并且它可以识别27个亚属 ， 5个属和2个亚科的49个物种 ， 它们属于属于Riboviria界、Nidovirales目、Cornidovirineae亚目、Coronaviridae科 。 物种科分类和分类名称（分类法）是由冠状病毒研究组（CSG）开发的 ， 该研究组是国际病毒分类法委员会（ICTV）的工作组 。 CSG负责通过评估病毒与已建立的分类单元中已知病毒之间的关系来评估病毒的新颖性 ， 就本文而言 ， 特别是在与严重急性呼吸综合征相关的冠状病毒物种的背景下 ， CSG负责评估病毒的新颖性 。 要了解与严重急性呼吸系统综合症相关的冠状病毒和SARS-CoV之间的区别 ， 即物种与病毒之间的区别 ， 在几种冠状病毒的完整分类结构的背景下以及与病毒宿主（尤其是人类）分类学比较时 ， 研究它们之间的关系可能是比较有效的（图1） 。 因此 ， 如果具有特定基因组序列的SARS-CoV-Urbani可被视为等同于一个人 ， 那么严重急性呼吸综合征相关冠状病毒科则与智人同等 。 但是鉴于冠状病毒在实践中分类到物种的方式 ， 这种类比可能超出语义学意义 ， 并且具有生物学意义 ， 尽管该概念在病毒学中的扩展尚待开发和全面测试 。 图1


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