病毒@研究发现:华南海鲜市场并非病毒发源地,专家解析下一步如何找到源头?

新型冠状病毒究竟来自哪儿?这是许多科研人员迫切希望寻找的答案 。 只有找到源头 , 才能彻底弄清新冠病毒的传播机制 , 避免疫情反复 。
日前 , 中国科学院西双版纳热带植物园、华南农业大学等机构科研人员 , 从基因组数据中挖掘新冠病毒的源头和传播路径 , 分析认为华南海鲜市场的新冠病毒是从其他地方输入的 。
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早在1月24日 , 刊发在权威医学期刊《柳叶刀》上的一项研究也显示 , 第一批41名确诊患者中 , 14人无华南海鲜市场接触史 , 推测病毒在进入华南海鲜市场前 , 可能已在其他地方出现和传播 。
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中科院等科研团队的这项最新研究 , 为此前的推测找到了基因组数据的证据 。
《生命时报》采访权威专家针对此次研究进行深度解读 , 并探究新冠病毒究竟可能来自哪儿 。
受访专家
武汉大学医学部基础医学院病毒学研究所教授 杨占秋
全国新冠肺炎医疗救治专家组成员、上海市公共卫生临床中心党委书记 卢洪洲
新研究:病毒源头不在华南海鲜市场2月21日 , 中国科学院“科技论文预发布平台”发表了题为《基于全基因组数据解码新型肺炎冠状病毒的进化和传播》的论文 。
中国科学院西双版纳热带植物园、中国科学院核心植物园、华南农业大学、韶关大学、北京脑科学与类脑研究中心等5家机构的研究人员 , 收集了全世界各领域发布到全球共享数据库中的93个新冠病毒样本的基因组数据(截至2020年2月12日) 。
数据覆盖四大洲12个国家 , 基于120个变异位点(碱基替换)共编码58个单倍型(病毒类型) , 其中31个在中国和其他国家都存在 。
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结果发现 , 来自华南海鲜市场患者样品单倍型都与H1有关 。 H1之后 , 发现了它的多个衍生单倍型如H2、H8-12 。
但是 , 单倍型H1由H3衍生 , H3由更古老的H13和H38转化而成 , 现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型 , 由此推断 , 新冠病毒可能来自华南海鲜市场之外 , 而且出现更早 。
科研人员提出 , 单倍型 H13 和 H38 的病毒样品 , 分别来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例) , 他们在2019年12月底至2020 年1月初来过武汉 。 这项研究中武汉患者的数据 , 最早是12月24日的 , 现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型 。
根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断 , 病毒可能在2019年12月初 , 甚至11月下旬已开始人际传播 , 随后在华南海鲜市场加快了人际传播 。 但由于一些感染者最初出现的只是轻度症状 , 导致这一情况被忽视 。
武汉大学医学部基础医学院病毒学研究所杨占秋教授说:“这项研究通过新冠病毒单倍型的演变过程 , 说明华南海鲜市场并不是新冠病毒的发源地 , 病毒是从其他地方输入的 。 但是 , 华南海鲜市场内售卖动物种类繁多、商铺拥挤、人员交流频繁等因素 , 促进了病毒在动物与人、人与人之间的快速传播 , 并蔓延到市场之外 。 ”
如何找新冠病毒源头?如果华南海鲜市场不是新冠病毒源头 , 那么到底是哪里呢?
为研究这一问题 , 研究人员细分来源 , 将58种单倍型分成五组 , 包括H1、H3、H13以及2个新的超级传播者单倍型H56和mv2 。 以此鉴别出广东的病毒可能有3个来源;重庆和台湾的病毒可能有2个来源;澳大利亚、法国、日本、美国患者的感染源至少有2个 。
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▲新冠病毒单倍型的样品采集时间情况 , 其中红色圆点的样品确认与华南海鲜市场有关;蓝色圆点的样本确认与海鲜市场无关 。
对此 , 杨占秋教授表示:“这个发现提示我们 , 新冠病毒可能同一时期有多个发源地 , 有可能来源于不同动物、不同人或不同地域 。 因此 , 病毒传播的中间宿主也可能有多个 , 需要寻找不同类型的来源 , 这给寻找源头工作和疫情防控带来了更多挑战 。 ”
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杨占秋教授进一步分析 , 如果华南海鲜市场的病毒是从外面输入的 , 接下来可以追溯:市场里售卖的不同动物都从哪里来?是什么人或什么动物最早把病毒带进了市场?他表示 , 从最早一批病人找源头很重要 , 需要把共性搞清楚 , 研究这些病例之间的联系 , 比如都去过某个地方 , 都吃过某种东西等 。
此前对华南海鲜市场的调查溯源也是非常重要的 , 要争取对市场内每一商户、每种动物来源地进行病毒的逐一检测和排除 。
没有华南海鲜市场接触史的这部分人也要关注 , 需要了解医学检查记录 , 仔细询问接触史、旅行史、生活轨迹等 , 可为寻找到新源头的共性线索提供帮助 。


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