英特尔、联想携手华大基因，加速新型冠状病毒基因组分析( 二 ) 2020年3月3日

　　在基因测序工作中，每毫升体液通常会包含数百万个不同的病毒体，而每个病毒体的基因组则包含大约30,000个DNA碱基或字母。华大基因正在对许多感染患者和疑似感染患者的微生物进行基因测序，因此这些研究工作将会生成TB级乃至PB级的海量数据。要想高效地快速处理这些重要数据，就需要采用更为先进的HPC基础架构、计算技术以及优化的基因组分析方法。

　　华大基因总部位于深圳，是全球领先的专注于生命科学和基因研究的公司之一。华大基因首席信息官晋向前表示：“华大基因已对数百份临床样本进行了测序，以分析和区分感染的并发症。生物信息学领域的技术，例如基因组比对、基因组组装、基因组注释和病毒核酸片段的系统分析，是一个高密度的计算过程，因此足够的高性能计算对于提高分析效率至关重要。能够使用最新的高性能计算和基因组分析技术是提高分析效率的重要因素。该设备和技术将加快对新型冠状病毒感染者的快速识别和病毒基因组特性的研究，为新型冠状病毒的精准诊断、治疗和疫情防控提供强有力的支持。 ”

英特尔、联想携手华大基因，加速新型冠状病毒基因组分析。　　【注1】联想的GOAST架构基于博德研究所(Broad Institute)的GATK Germline的验证标准，在NA12878样本的30倍全基因组和50倍外显子上调用工作流，将性能提升最高达40倍，这是一个精心策划的参考人类基因组，代表了基因组学领域的高质量黄金标准。有关详细信息，请参阅https://en.resources.lenovo.com/intel-select-solutions/goast 。结果可能无法反映所有公开可用的系统调整。性能可能因输入数据大小、输入格式、排序深度/覆盖范围、顺序工作流中的分析步骤、生物信息学工具的选择、工具版本和集群环境而异，但不限于此。

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