■宏基因组测序（mNGS）助力新冠病毒检测( 二 )
针对检测时间长的问题 ， 达仁基因开发并免费开放了Apollo 2019-nCoV在线工具 ， 医疗和科研人员可以直接在线进行分析mNGS数据 ， 并自动相关分析报告 。整个过程大约只需6分钟 。
阿里云更近一步 ， 免费开放的基因计算服务AGS（Alibaba Genomics Service） ， 采用容器技术和GPU ， 即开即用 ， 可同时运行多个病毒基因比对服务 。检测时间不到60秒 。
结语
因此 ， 建议将mNGS 和RT-PCR进行优势互补 。前期大规模筛查 ， 使用操作速度快成本低的RT-PCR ， 以便快速进行初步鉴定新型冠状病毒核酸阳性；而对于“假阴性” ， 就可以进一步利用mNGS进一步确认可有效提高检测结果的可靠性 ， 并获得是否有其他病原体感染的综合信息 ， 可以对病原微生物起到一网打尽的效果 。
主要参考资料：
1. https://iivd.net/article-21164-1.html
2. https://science.sciencemag.org/content/291/5507/1221.full
3.https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1074552198901089
4. https://www.sohu.com/a/326265953_733985
5.http://sh.sina.com.cn/news/k/2020-02-17/detail-iimxxstf2141891.shtml
6. https://mp.weixin.qq.com/s/O4oWt4-LInQ3ICZr-tApsQ
7.https://developer.aliyun.com/article/748300?groupCode=genomics
8.https://www.nature.com/articles/s41586-020-2008-3
【■宏基因组测序（mNGS）助力新冠病毒检测】9. https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.17.951335v1
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