#新浪科技综合#因为Excel，科学家们修改了27种人类基因的名称新浪科技综合2020-08-11 10:07:110阅
来源： DeepTech深科技
电子表格类软件 ， 已经深度参与到我们日常工作的各个环节 。
【#新浪科技综合#因为Excel，科学家们修改了27种人类基因的名称新浪科技综合2020-08-11 10:07:110阅】而其中的翘楚无疑是微软的 Excel ， 不管是 WPS 或是 Numbers ， 都无法撼动这款已经拥有 35 年历史的软件 。 但最近它的某些功能却给一些科学家们带来了困扰 。
藏在基因名称中的“隐患”
人类基因组 ， 有 23 对染色体 ， 包含约 30 亿个 DNA 碱基对 ， 部分碱基对组成了大约 20000 到 25000 个基因 。 在科学研究中 ， 学者需要为每个基因起一个特定的名称以便快速定位 ， 这些名称一般由字母加数字的形式组成 。
但是在最近一年左右的时间里 ， 有约 27 种人类基因被重新命名 ， Excel 正是这一系列行为的“肇事者” ， 它会将这些基因名称误读为日期格式 ， 并直接修改成了默认格式 。
这种事情并不新鲜 ， 我们每个人或多或少都遇到过类似情况 。
但是 ， 当 Excel 将一些关键数据误读 ， 而科学家们恰好使用这些数据来分析 ， 甚至临床试验的时候 ， 就可能产生不可挽回的严重后果 。
当遇到类似情况时 ， 科学家们必须手工设置单元格格式以还原数据 ， 但难免也会产生遗漏的情况 。 据一项 2016 年的调查表明 ， 这类 “Bug” 非常普遍 ， 以至于在 3597 篇样本论文中 ， 约五分之一都受到了影响 。
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图1/6图 | 微软 Excel 将基因名称误读作日期“这真的非常非常烦人” ， 英国 Quadram 研究所的系统生物学家 Dezs? Módos 在报道中这样描述 。 他的工作会涉及到分析新近测序的遗传数据 ， 他说这类 Excel “错误”非常常见 ， 而恰好 Excel 是科学家们分析数据时的首选 。 “在解决计算问题的时候 ， 它真的很方便” 。
并没有一种简单的解决方法能够修复这类“Bug” ， Excel 没有关闭自动修改格式的开关 ， 为了避免自动“转型” ， 只能重设整列单元格数据类型 。 但是这种修复是一次性的 ， 一旦其他人引用了相关数据 ， 问题会再次出现 。
改名 ， 是为了彻底解决问题
国际人类基因组组织（HUGO）下辖的 HGNC（基因命名委员会） ， 近期发布了包含 “影响数据处理和索引的符号” 的关于基因命名格式的新指南 。 从今往后 ， 人类的基因命名将避开 Excel 的“Bug” 。 例如：MARCH1 将变为 MARCHF1；SEPT1 变为 SEPTIN1 。
这并不是一个轻易作出的决定 ， HGNC 的权威性来自科学家群体的共识 。 HGNC 必须及时通知受到改名影响较大的群体 ， 从改名到日常使用将是一个缓慢的过程 。
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图2/6图 | 美国国家生物技术信息中心（NCBI）已经更新此前 ， 在遗传学早期 ， 基因的命名一度非常随意 ， 往往体现了科学家的强烈个人偏好 ， 例如 “臭名昭著” 的“音速刺猬索尼克”、INDY（I’m not dead yet）等等 。
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图3/6图 | 左边是索尼克 ， 右边也是索尼克不过现在 ， HGNC 已经将命名规则制定权牢牢掌握在手中 ， 在他们的规则下 ， 基因的命名不再能够让科学家们自由发挥 ， 基因名称不得使用上标或下标 ， 只能包含字母和数字 ， 不能由姓名或单词组成 ， 尤其是一些令人反感的词汇 。
为了避免在搜索时产生歧义 ， 他们曾经将 CARS 基因更名为 CARS1、WARS 更名为 WARS1 等等 。
HGNC 的协调员 Bruford 说道 ， 这是第一次该组织针对软件问题而对基因名称及命名规则进行修改 ， 截止目前 ， 收到的反馈总体上是积极的 。
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图5/6图 | 生物学家的回应但 Bruford 也提到 ， 他们听到了一些争议的声音：为什么选择重新命名人类基因 ， 而不是修复 Excel 的“Bug”？为什么整个遗传学界会输给一家商业公司？
微软并未对此置评 。
但 Bruford 这样解释道 ， Excel 并不值得因此而改变所有的产品功能 ， 我们在微软庞大的用户群中只占很小的一部分 。 如果微软就此做出修改 ， 反而将对更多的人造成影响 。
最后她说 ， 同永恒的人类基因相比 ， Excel 不过沧海一粟 。
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