1700年前后 ， 欧洲关于中国礼仪的争论进入了高潮 ， 影响波及中国 。1702年 ， 耶稣会士在中国各地广泛征集对祭祖祭孔礼仪的看法 ， 上至皇帝、大臣 ， 下至一般文人和教徒 ， 以上呈教廷 ， 为教皇裁定作参考 。多罗正是在这种情况下应教皇克莱门十一世（1700—1721）之命出使远东 ， 来华目的就是禁止祭孔、祭祖的礼仪 。多罗1703年离开欧洲 ， 经印度、菲律宾 ， 于1705年4月到达澳门 ， 之后启程北上 ， 于当年12月4日抵京 。一开始多罗隐瞒了来华的真实使命 ， 对于皇帝的询问含糊其辞 ， 只是说感谢康熙对传教士的“柔远重恩” ， 因此受到了康熙皇帝空前热情的接待 。
然而多罗在公开来华禁止祭祖祭孔的使命之后 ， 引起了康熙皇帝大怒 ， 不再善待多罗 ， 并任命皇长子直郡王负责与传教士交涉 。1706年8月 ， 多罗离开北京 ， 沿运河坐船南下 ， 准备返回欧洲 。
如果说在此之前礼仪之争还只是天主教的内部事务 ， 那么由此开始则逐渐演变为教廷与清廷的外交危机 。康熙感到皇权受到了外来干涉 ， 大为不悦 ， 于是在1706年12月发布谕旨 ， 要求在华传教士来京领“票” ， 以获取传教与居住的资格 ， 并开始限制传教士的活动 。但同时 ， 康熙还是准备与教廷沟通 ， 派遣了数批耶稣会士赴罗马斡旋 。欧洲所藏档案记载了康熙要求传教士领票的经过和大致内容：
多罗直郡王、武英殿监看制造等项员外郎赫世亨、张常住 ， 养心殿看制造等项赵昌等 ， 于本月初七日同议具题随奏 ， 凡各省天主堂居住传教西洋人等有内务府印票者 ， 任其行走居住 ， 不必禁止 ， 不给印票者 ， 凡堂不许居住 ， 往澳门驱逐 ， 凡新旧西洋人等在各省要领票来京者 ， 不得阻滞 ， 但不许久住 ， 急速催往来京 ， 嗣后将给票不给票人等名姓开写 ， 交与包衣大人 ， 由伊衙门行礼部 ， 由礼部转行各省 。等因具题 ， 奉旨：依议 。交与礼部 。钦此 。
嗣后西洋人来京给有票者即行贵部外 ， 将先经领内务府印票西洋人数目一并移送等语 。嗣后相应将西洋人给与印票者 ， 凡堂居住 ， 不必驱逐 ， 不给印票者 ， 地方官不许容留 ， 往澳门驱逐前往 ， 有情愿领票者 ， 彼地方毋得久留 ， 着速来京 ， 为此将给予印票不给予印票人等姓名开列 ， 一并移送贵部 ， 相应知会通行直隶各省可也 。为此知会 ， 等因到部 ， 相应移咨直隶各省可也 。
这道旨意发布之后 ， 就陆续有一些传教士到北京领票 。多罗得知这一消息时 ， 已到达南京 ， 对此他采取了强硬的回应措施 ， 于1707年1月25日发布了“南京敕令” ， 要求所有在华的传教士严禁中国礼仪 ， 这一决定使康熙更加震怒 ， 教廷与清廷的外交危机进一步升级 。从1706年12月到1707年3月 ， 多罗在南京停留了约3个月之后回到广州 ， 准备在那里等待法国或英国的贸易船只 ， 返回欧洲 。但是他刚到广州 ， 就接到上谕 ， 受命不得登船返航 ， 要他到澳门暂住 。1707年6月 ， 多罗及其随员在官员们的护送下 ， 再度到达澳门 ， 失去了人身自由 。被祝圣为枢机主教的多罗 ， 1710年6月死于澳门囚所 。
我们再回头看康熙皇帝的最后一次南巡 ， 行程大约是这样的：1707年2月24日 ， 康熙从北京出发 ， 随行的有皇太子、皇长子（多罗直郡王）、皇十三子、十五子、十六子 。经东昌府 ， 2月11日到达济宁 ， 3月30日到达扬州宝塔湾行宫 ， 经句容 ， 4月8日到南京 ， 在南京期间 ， 观看了军队的演武操练 ， 还拜祭明太祖孝陵 ， 4月13日离开南京 。后经句容、镇江、常州、无锡、苏州、松江、嘉兴 ， 于四月到仁和（杭州） ， 并驻跸西湖行宫 。后经嘉兴、苏州府、丹徒、扬州（四月甲午 ， 宝塔湾行宫）北返 。
我们看到这次南巡正好在多罗发布南京敕令之后不久 ， 因此康熙皇帝正处于对于教廷特使的极度愤怒当中 ， 对于传教士也失去了原本的和颜悦色 ， 在途中接见传教士都是要他们选择立场 ， 决定去留 。
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