非洲猪瘟病毒里 基因“针线”绣功了得( 五 )
预测之后 ， 必须亲见 。 利用X-射线晶体学方法获取酶与DNA作用的“影像” ， 将对酶与底物相互作用时的“凹造型”一目了然 。
为此 ， 根据已经获得的连接酶分子结构 ， 参考相关文献 ， 团队设计了10几种可能的DNA片段 ， 试试连接酶的“功力” 。 “DNA片段有长有短 ， 含有的碱基对数量8到20个不等 。 ”李继喜说 。
对于这些不同的DNA底物分子 ， 连接酶表现了不同的活性 。 从本质上说 ， 它们之间的反应是酶促反应 。 分析发现 ， 非洲猪瘟病毒连接酶在底物催化位点附近具有一些明显不同的氨基酸组成 。 蛋白突变、体外DNA结合以及活性研究显示 ， 催化位点附近的氨基酸对其与DNA形成复合物及活性至关重要 。
李继喜解释道：“单独的酶的构象可以想象成一个三节棍 ， 当和DNA作用时 ， 这个三节棍的三段会发生变化 ， 收拢到一起形成一个‘口袋’状 ， 把DNA关在里面 ， 促成DNA连接反应的进行 。 ”
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