中药抑制炎癌转化机制有望揭晓( 二 )

课题组提出了一个结合计算预测和实验分析为一体的

社会

方法 , 这一方法可以发现消化系统炎癌转化过程是如何发生和进展的 。

随后课题组利用CIPHER(一种自主研制的、基于网络的全基因组致病基因预测方法)进行炎、癌相关基因预测 , 结合临床上消化系统不同部位(胃、肠和肝)、不同阶段(正常人、炎症和癌症患者)的公共基因表达谱数据 , 筛选出了哪些基因可能会影响消化系统的炎癌转化进程 , 也即与消化系统炎癌转化显著相关的候选基因集 , 构建出影响炎癌转化的关键因子网络 。

接着 , 课题组使用转化生长因子(TGFβ1)诱导肠上皮细胞恶性转化 , 并用新的CRISPR-Cas9组合(一种基因治疗法 , 这种方法能够通过DNA剪切技术治疗多种疾病)进行筛选 , 识别炎癌转化关键子网中的差异遗传相互作用网络模块 。 通过对炎症诱导的差异遗传相互作用网络模块分析 , 揭示了显著差异的基因之间的功能协同特征 。


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