癌症背后谁在操控细胞功能?( 六 )

主要结论:

前列腺癌细胞中 , TADs更小 , 数量增多 。 包含TP53基因座的片段的缺失促进形成了新的TAD结构 。 癌细胞特有的TAD边界富含CTCF和H3K4me3 。

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图6健康细胞系和癌细胞系染色体互作热图

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肿瘤Hi-C研究思路

为了方便大家参考 , 整理了一套肿瘤Hi-C研究思思路 。

1.材料选择:疾病细胞/组织、正常细胞/组织

2.测序策略:建议分辨率5-40kb , IlluminaPE150测序

3.多组学策略:RAN-seq、ChIP-seq、WGS、ATAC-seq


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