董莎萌:用大数据“治疗”马铃薯癌症
----董莎萌:用大数据“治疗”马铃薯癌症//----[ ]
“太惨了 , 马铃薯叶子和茎秆上布满了病斑 , 约2000亩的农田可能颗粒无收 , 罪魁祸首就是晚疫病 , 该病又被称为马铃薯癌症 。 ”前不久 , 贵州省贵阳市息烽县南挢村马铃薯田的“遭遇” , 让董莎萌十分忧心 。
为缓解“疫情” , 这位南京农业大学植物保护学院教授、博士生导师和他的学生连夜对“患病”马铃薯进行采样分析 , 破解了致病菌的基因组 , 并筛选出两款抗病性较好的马铃薯 , 推荐给当地农民 。 “明年 , 那里的农民就可以种这些抗病品种了 。 ”董莎萌说 。
这只是董莎萌接手的众多“病例”之一 。 38岁的董莎萌像一位植保界的“外科医生” , “追”着疫情跑遍全国的马铃薯晚疫病疫区;他又像一位植保界的“码农” , 开发出马铃薯晚疫病大数据监控系统 , 研究我国晚疫病发病与流行规律 。
日前 , 董莎萌在国际上首次在三维水平 , 对海量作物病菌资讯实现了提取、运算与分析 , 并对病菌的致病型进行了高精度预测和类比 。
死磕3年绘成基因组图谱
开启南京农业大学马铃薯晚疫病卵菌菌株生化培养箱 , 一个个布满菌丝的培养皿映入眼帘 。 在这个资源库里 , 保存着450多份具有代表性的晚疫病菌株 , 这是董莎萌所在团队用12年收集来的 。 它们有的来自英国、荷兰、法国 , 有的则来自我国黑龙江、福建、安徽、贵州等马铃薯主产区 。
“中国的马铃薯产量世界第一 , 且国家推行了马铃薯主粮化战略 , 而晚疫病是马铃薯的头号‘杀手’ , 若弄清了我国晚疫病的发病与流行的规律 , 就可让农民少打农药 , 指导他们精准选育、丰产丰收了 。 ”穿着白大褂 , 行走在实验室里的董莎萌脚步飞快 。
由於对晚疫病的原有认知不足 , 研究工具又很有限 , 至今我国学者对晚疫病的致病和成灾机制 , 还不是十分清楚 。 但2017年夏天的一个夜晚 , 董莎萌迎来了高光时刻 。
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