董莎萌：用大数据“治疗”马铃薯癌症( 二 ) “太慘了

　　那晚10点多，董莎萌和学生绘制的国际首个三维晚疫病表观基因组图谱问世。此前，他们就此研究了近3年。

　　这张图谱，源於董莎萌2014年开始设计整合的一款晚疫病基因组的三维大数据监控系统。 “以往国内外科研人员分析晚疫病菌脱氧核糖核酸（DNA）时，只能以二维视角监测基因序列是否发生变异。但三维系统，能看到每个基因序列的空间和结构资讯。 ”他说。

　　跨越生物学和计算科学两个领域进行研究，这曾一度让董莎萌陷入至暗时刻。 “2015年前後，我感到非常痛苦，团队都是做生物研究的，而进行大数据分析需要懂演算法。 ”董莎萌说。

　　为恶补演算法短板，董莎萌开启“学霸模式” ，每天十几个小时泡在实验室，一边自学编程、演算法，一边四处给专家、同行写信求助， “但吃了不少闭门羹” 。即便到了半夜12点，董莎萌办公室的灯还常亮着。

　　最终，他将传统计算机20多天才能完成的晚疫病致病型数据分析，压缩到了2天。如今，实验室的资料库里，已存储了70余张我国菌株的2维基因组图谱，三维的晚疫病菌表观基因组图谱已增至15张。

　　一说有疫情就奔赴疫区

　　户外鞋、冲锋衣、GPS定位仪、大量的采样袋……这些东西堆满了董莎萌的办公室。一旦说哪里出现晚疫病疫情，他带着这些“神器” ，说走就走。

　　“我们赶病害的，拖拖拉拉就可能错过最佳采样时机了。 ”有一次，他上午10点接到电话，下午4点就出现在安徽省界首市的地头上。

　　在我国，马铃薯晚疫病的发病率接近40% ，由此每年造成的损失超过70亿元。晚疫病，已日渐成为制约我国马铃薯产业发展的主要瓶颈。

　　这些年，为了采集尽可能多的菌株，董莎萌先後来到黑龙江、内蒙古、福建、安徽、云南、贵州、重庆、陕西、甘肃、宁夏、浙江等马铃薯产区。

　　晚疫病病情暴发的疫区，大多分布在山沟里。有一次，董莎萌带着学生去宁夏省固原市采样，下了飞机赶大巴再挤农机车，跟鸡鸭挤在一起，折腾了快两天，最终才抵达晚疫病疫区。

董莎萌：用大数据“治疗”马铃薯癌症( 二 )