新冠病毒被正式命名SARS-CoV-2( 四 )

新冠病毒被正式命名SARS-CoV-2。事实上，这一命名背后，是有着复杂的鉴定、规范性流程的。根据论文所述，要了解与严重急性呼吸系统综合症相关的冠状病毒和SARS-CoV之间的区别，即物种与病毒之间的区别，需要新冠病毒在几种冠状病毒下进行测试观察，研究它们之间的关系，以及病毒宿主来源之间的区别。

在观察时， CSG研究人员发现，新冠病毒的基因组序列与 SARS-CoV-Urbani 是同一个，尽管新冠病毒与 SARS 病毒本身不同，但是这种与之平行，超出了新语境，并且具有生物学意义，尽管该概念在病毒学中的扩展尚待开发和全面测试。

CSG使用了比较基因组学的计算框架，用专门知识和工具来评估个体之间的差异。该框架由与 Nidovirales 顺序的分类和命名有关的几个研究组共享，并由 Nidovirales 研究组进行了协调。研究小组量化并划分了冠状病毒基因组的开放阅读框中编码的最保守的复制蛋白的变异以鉴定划分成对的阈值不同级别的病毒簇。

研究过程中， CSG科研人员发现，严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒和 Beta 冠状病毒属物种中的 SARS-CoV-2 与 SARS-CoV 簇聚，而在不同的研究中，尽管 SARS-CoV-2 与最紧密相关的冠状病毒之间的距离估算值会有所不同，具体取决于测量方法(核苷酸或氨基酸)的选择和基因组区域。但两者之间，是存在一定联系的。

因此，研究人员对包括 2505 种冠状病毒的数据集进行合并分析时发现， 2019 新型冠状病毒（2019-nCoV）可以被指定为严重急性呼吸综合征相关冠状病毒，也就是SARS-CoV-2 。并且， CSG认为，该物种的已知病毒的基因组变异与其他相对良好采样的物种（例如，由 MERS-CoV ， HCoV-OC43 和 IBV 原型化的病毒）相比，差别较小。

根据该物种中病毒命名的惯例以及物种树和距离空间中 SARS- CoV-2 与原型 SARS-CoV 的相对较远的关系（图 2B 和 4）， CSG 重命名为 2019- nCoV 到 SARS-CoV-2 。

而严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒物种的这两个特征都有助于将 SARS-CoV-2 明确分配给该物种，对其后续研究有帮助。

由SARS-CoV-2引发的疾病被命名为COVID-19

以上结果表明，就分类学而言， SARS-CoV-2 是(仅)严重急性呼吸综合征相关冠状病毒物种中的另一种病毒。在这方面，该病毒的发现与21世纪引入人类的其他两种人畜共患冠状病毒 SARS-CoV 和 MERS-CoV 的描述有很大不同。根据两个非正式物种的原型，该研究小组认为新的冠状病毒是冠状病毒属的一个亚类。这些病毒及其类群被赋予了新的名称，其来源反映了相应时间的实践和病毒分类的状态。

与 SARS-CoV 相比， SARS-CoV-2 的名称并非源自SARS疾病的名称，并且绝不应该使用它来预先定义疾病的名称(或谱图)由人类 SARS-CoV-2 引起的疾病，这将由 WHO 决定，也就是新命名的 COVID-19 。

SARS-CoV-2 的可用流行病学和临床数据有限，表明该病毒和 SARS-CoV 的疾病图谱，传播方式可能有所不同。同样，用于确认 SARS-CoV-2 感染的诊断方法与 SARS-CoV 的诊断方法也不相同。这反映在针对 SARS-CoV-2 / 2019-nCoV 的针对公共卫生从业者，医护人员和实验室诊断人员的具体建议中。通过将新型冠状病毒与其他人类与动物之间引起的疾病名称区分开来， CSG 希望以最适当的方式帮助 WHO 命名病毒。