华南海鲜市场不是病毒发源地！( 二 )

为什么有 2 个“古老的”单倍型呢？郁文彬对 DeepTech 解释说，其实 H13 和 H38 ，以及 H3 ，它们两两之间只有 1 个核苷酸位点的差异，有可能是衍生到 H3 后，发生了一次转换的回复突变，衍生到另外一种基因型基因型。并且两者都是同义突变，即该突变不影响基因表达的结果。这就意味着 2 个“古老的”单倍型极为接近。

现有武汉样本中没有检测到 H13 和 H38 单倍型，作者推测可能是因为现有样品主要采自几家定点医院，而且样品采集时间局限于 2019 年 12 月 24 日和 2020 年 1 月 5 日。那么，如果能在武汉其他医院早期的病患中检测到这两种单倍型，将对于寻找病毒来源非常有帮助。

对于单倍型 H3 ，其武汉样本的发现时间在 2020 年 1 月，但这并不意味着其基因型更“年轻” 。郁文彬解释说，可能是因为病毒在被传染到这位携带者身上没有发生变异，或者很早传染到这位患者，只是没有发病。

追踪“零号病人”

图 | 新型冠状病毒单倍型的样品采集时间情况。红色圈的样品是确认与华南海鲜市场有关；蓝色圈的样本确认与海鲜市场无关（来源：郁文彬）

华中农业大学一位匿名教授评价说，这是一项基于现有新型冠状病毒基因组序列的研究。理论上根据其变异的情况，是能够溯源各个样本之间的关系，到底是父子关系还是兄弟姐妹关系，到底复制了多少代。那么就可以最终追溯出最早的新冠病毒从哪里来。当然这里有一个假设是病毒是从动物传播到人。

在华南海鲜市场之外发现单倍型 H3 也就意味着， H3 携带者传染了去华南海鲜市场的人，结果将人流拥挤的华南海鲜市场变成了病毒传播爆发点。

他认为，溯源很重要，这个研究是通过大数据分析的，非常有意义。最核心的调查是最早感染新冠病毒的那几个人，这尤其需要医院配合，但是医院可能现在没心思、没精力来做这件事，那些医生可能也没有进化基因组学的背景，所以他们也可能没有认识到这件事的价值。

他说，至于这个最原始的携带者，也就是“零号病人” ，可能是接触蝙蝠的人。理论上还是能够追溯的，即使零号病人已经去世，在某个医院应该还保留了他的血液样本。

郁文彬认为，最原始的单倍型不太可能存在现在的患者身上，因为病毒的变异太快。他们现在能拿到的数据已经是最早是 12 月 24 日，因为没有早期的样本就很难去溯源， “我们猜测国内医院可能没有保存早期患者的组织材料，当然我们非常希望有早期的样品存在” 。

郁文彬表示，这个研究有个不足，那就是 93 个样本中，武汉样本主要是早期的，如果有更多武汉样本进行基因组测序的话，可能在溯源方面可以找到更多的证据，比如说找到 H13 和 H38 单倍型，可能可以帮助找到病毒来源。

一个好消息

郁文彬说，这项研究主旨是分析整个新冠病毒基因组的变异情况，以及弄清楚新冠病毒传播式样，基于传播和扩散的分析，为寻找病毒来源提供基因上的证据。

研究人员发现新型冠状病毒基因组没有发生重组事件， 93 个基因组之间有 120 核苷酸发生了突变（0.41% 序列长度），并均匀分散在 10 个编码区。 120 个突变的核苷酸关联了 119 个氨基酸密码子，其中 79 个密码子（65.83%）改变了氨基酸类型，并有 42 个（53.17%）氨基酸理化性质都被改变。