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中国科学家：新冠病毒已演化出两个亚型，毒力区别大

每经编辑 孙志成    
新冠病毒是否已经发生突变？如何突变？这是目前学界研究的焦点之一 。
3月3日 ， 中国科学院主办的《国家科学评论》（National Science Review）发表题为《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》的论文 ， 通过对迄今最大规模的新冠病毒全基因组分子进化分析 ， 揭示了新冠病毒已经演化出L和S两个亚型 。 其中S型是相对更古老的版本 ， 而L亚型更具侵略性传染力更强 。 对不同亚型的深入了解 ， 将有助于新冠肺炎的差异化的治疗和防控 。
研究发现新冠病毒演化出两个亚型
中国科研团队最新发现显示：
新冠病毒已于近期产生了149个突变点 ， 并演化出了两个亚型 ， 分别是L亚型和S亚型 。
研究发现 ， 在地域分布及人群中的比例 ， 这两个亚型表现出了很大测差异 。
【中国科学家：新冠病毒已演化出两个亚型，毒力区别大】以上研究来自中国科学院主办的《国家科学评论》（National ScienceReview）于3月3日发表的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》（On the origin andcontinuing evolution of SARS-CoV-2） 。
论文通讯作者为陆剑研究员（北京大学生命科学学院生物信息中心）、崔杰研究员（中国科学院上海巴斯德研究所） 。
在这103个病毒株中 ， 有101个属于两个亚型之一 。 具体而言 ， 两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点 ， L型是T碱基（对应亮氨酸 ， Leu） ， S型是C碱基（对应丝氨酸 ， Ser） 。 通过与其他冠状病毒比较 ， 作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近 ， 从而得出S型相对更古老的结论 。
中国科学家：新冠病毒已演化出两个亚型，毒力区别大
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两种新冠病毒亚型在时间和空间分布上存在差异（图片来源：论文截图）
但研究人员意外发现 ， 相对古老的S型新冠病毒并没有因为在人群中传播的时间更长 ， 而感染更多的人 。 基因组数据表明 ， 感染S型的比例占30% ， 反倒是相对年轻的L型新冠病毒的感染比例占70% ， 而且每个L型病毒株比S型携带了相对更多的新生突变 。
基于上述反常现象 ， 作者推测：“L型病毒传播能力更强 ， 或者在人体内复制更快 ， 因此可能意味着其毒力也更大 。 ”
作者还专门比较了1月7日前后S型和L型所占比例的变化 ， 他们发现L型在病毒株中的比例下降 ， S型比例上升 。 作者由此推测：“这可能是因为L型病毒的患者更容易表现出症状 ， 因而更容易受到人工干预 ， 从而使L型新冠病毒受到的负选择压力更大 ， 感染的人数由此变少 。 ”
中国科学家：新冠病毒已演化出两个亚型，毒力区别大
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 103个新冠病毒毒株的进化树（图片来源：论文截图）
L亚型在武汉爆发的早期阶段更为普遍
， 而L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降 。 作者认为 ， 人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力 ， 如果没有这些干预 ， L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速 。 另一方面 ， 由于选择压力相对较弱 ， 在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加 。 这些发现意味着 ， 目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒病患者临床症状图表记录 ， 进行进一步的全面研究 。
中国科学家：新冠病毒已演化出两个亚型，毒力区别大
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103个新冠病毒毒株的衍生突变频谱分析 ， 橘黄色为非同义突变、绿色为同义突变
（图片来源：论文截图）
另外 ， 值得注意的是 ， 这103个样本显示 ， 大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个 。 但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株 ， 这两个位点却均呈现了C和T的混合现象 ， 也就是说 ， 很有可能这位患者同时感染了L型和S型新冠病毒 。 不过 ， 作者表示目前还无法排除新突变型的可能性 。
巴西患者病毒基因有3处突变
巴西在2月26日出现首例确诊病例 。 当地科学家与英国科学家合作 ， 紧急针对该名61岁的巴西患者进行“冠状病毒基因定序” ， 结果发现这名患者体内的新冠病毒同武汉公布的病毒基因相比存在3处不同 ， 表示病毒在传播过程中已经发生突变 。
据南方都市报 ， 3月1日 ， 一份发表在病毒学国际交流平台（Virological） ， 题为《First report of COVID-19 in South America》（南美洲首例新型冠状病毒报告）引发关注 ， 这是南美洲首次分析出新冠病毒的基因序列 ， 由巴西Adolfo Lutz国家研究所、国家参考实验室 ， 以及圣保罗大学（USP）、牛津大学热带医学研究所共同完成 。


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