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■研究发现新冠病毒的源头不是华南海鲜市场，这意味着什么？

#陇南全力战疫情#
■研究发现新冠病毒的源头不是华南海鲜市场，这意味着什么？
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1.中科院研究人员通过对93个新型冠状病毒的全基因组数据进行分析 ， 发现从武汉华南海鲜市场提取的病毒属于H1类型 ， 该病毒源于H3 ， H3是H13病毒和H38病毒的后裔 ， 而H13和H38病毒分别在广东首例患者和美国首例患者身上发现 。这意味着 ， 华南海鲜市场并不是最早的源头 。
2.此前柳叶刀发表的回溯性文章也发现武汉最早的病例有不少没有华南海鲜市场暴露史 。另一篇来自新英格兰医学的报道也佐证了这个事实 。所以无论是病例的溯源 ， 还是基因组学的证据 ， 都支持华南海鲜市场不是最早源头的结论 。
3.不过 ， 这个研究的样本还不够全面 ， 样本取样受到了人为的限制 ， 这导致最终的数据分析也受到影响 。目前尽管大概率排除了华南海鲜市场为首发地 ， 但从整个病毒的溯源来看 ， 病毒的集中爆发地 ， 依然存在于武汉或者湖北 。
4.目前病毒已经发生了许多突变 ， 可能引发一些潜在的威胁 ， 最终是否会影响新型冠状病毒的传染性、致病性等问题 ， 值得重视 。
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李雷
中国科学院生物学博士
新型冠状病毒肺炎暴发以来 ， 全民积极防疫 ， 医护人员在一线和病毒对抗 ， 科研人员在实验室为医护人员的治疗方案和用药提供源源不断的技术支持 。还有一群科学家 ， 他们承担了另一个艰巨的任务：对新型冠状病毒进行溯源研究 ， 以期寻找到病毒的源头从而掐断潜伏中的宿主 ， 避免下一次疫情的突然发生 。
最近 ， 有媒体报道称研究显示武汉华南海鲜市场并不是病毒的源头 ， 引发广泛讨论 。这个研究是怎么做的？结论靠谱吗？我们又该如何应对？
中科院的研究发现华南海鲜市场不是真正的病毒源头
■研究发现新冠病毒的源头不是华南海鲜市场，这意味着什么？
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2月19日 ， 中国科学院西双版纳热带植物园的研究人员在预印网站上分享了一篇对新型冠状病毒肺炎的溯源研究 ， 在该研究中 ， 作者提出了一个看法：华南海鲜市场并不是病毒的源头[1] 。
这篇研究是怎么做的呢？
研究人员首先从公共数据库GISAID EpiFluTM里下载了来自亚、欧、澳和北美四个州12个国家的93个新型冠状病毒的全基因组数据 ， 通过全基因组分析来进行溯源传染源和扩散路径的研究 。依据其基因组上的变异位点对这些病毒进行分类 ， 最后得出了58种单倍型 ， 它们可以被归纳成五大类（Group A、B、C、D、E） ， 如下图所示：
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进一步 ， 他们发现 ， 这些单倍型并不是完全平行 ， 而是存在一个进化上的先后顺序 。比如单倍型H3是比较古老的病毒 ， 而H1则是相对较新的病毒 。此外 ， 这些病毒的扩散也不是均衡的 。比如H1就是一个超级传播单倍型 ， 它衍生出了几十个单倍型 。
比较意外的是 ， 他们发现 ， 从武汉华南海鲜市场提取的病毒属于H1类型 ， 就是上图中下面那个大圈的中心病毒 。从图上大家可以直观地看到 ， 这个H1病毒 ， 并不是很古老的病毒 ， 它源于H3 ， 而H3是H13病毒和H38病毒的后裔 ， 而H38 ， 理论上是蝙蝠病毒RaTG13直系后裔 ， 通过一个未知的中间宿主mv1后形成的 。


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