《纽约时报》:纽约大部分新冠病例来自欧洲( 二 )



今年1月 , 一个由中国和澳大利亚研究人员组成的团队公布了这种新病毒的首个基因组 。
从那时起 , 世界各地的研究人员已经对超过3000个基因进行了测序 。 有些基因彼此相似 , 而另一些携带独特的突变 。

这只是病毒多样性的一小部分 。 截至4月8日 , 已确认的COVID-19病例为150万例 , 实际总数可能还不止数百万 。 但是 , 病毒的基因组已经揭示了过去几个月来隐藏的病毒历史 。

随着新基因组的出现 , 研究人员将它们上传到一个名为GISAID的在线数据库 。 一组病毒进化学家正在分析一个名为Nextstrain的项目中不断增长的基因组集合 。 他们不断更新病毒的族谱 。

《纽约时报》:纽约大部分新冠病例来自欧洲
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族谱最底部的分支都属于中国的血统 。 Nextstrain的研究小组还利用突变率判定 , 该病毒可能在2019年底首次从动物宿主转移到人类 。 12月31日 , 中国宣布武汉的医生正在治疗几十例神秘的新型呼吸道疾病 。

今年1月 , 随着中国暴发的范围变得越来越清晰 , 一些国家开始了一项积极的检测程序 。 他们能够追踪病毒到达他们的地域并追踪病毒在其人口内的传播 。
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但美国在制造第一批诊断试剂盒时出现了问题 , 并且只对来自中国并表现出COVID-19症状的患者进行了检测 。

“这是一个因为我们没有做检测而导致的灾难 。 ”埃吉博士说 。

有几个病例是在一月底开始曝光的 。 但人们很容易将它们忽视成不会导致当地疫情暴发的罕见的输入病例 。


在2月底这一幻想被华盛顿大学福瑞德·哈金森癌症研究中心的副教授特雷弗·贝德福德和他的同事们所打破 。

他们利用Nextstrain发现2月底在一名患者身上发现的一株病毒与1月20日在华盛顿发现的一株病毒发生同样的突变 。

华盛顿的病毒和武汉的病毒也有相同的变异 , 这表明是一名旅行者从中国带来了冠状病毒 。

基于这一发现 , 贝德福德博士和他的同事们率先对冠状病毒基因组进行了测序 。 对华盛顿周围更多的基因组进行测序 , 这让他们更好地了解了那里的疫情是如何开始的 。

“我可以十分自信地说去年12月病毒没有在美国蔓延, ” 贝德福德博士说 , “1月份可能还有几个同样的输入性病例没有以同样的方式蔓延 。 ”

随着在美国其他地区出现新病例 , 其他研究人员建立了自己的渠道 。 纽约的第一个阳性检测结果是在3月1日 , 几周后 , 患者涌入纽约市的医院 。

“我认为 , 我们应该为纽约做这件事 。 ”埃吉博士说 。

埃吉博士和她的同事发现了一些纽约病毒所具有的其他地方没被发现的独特突变 。 她说:“那时你知道病毒已经悄无声息地传播了一段时间 。 ”

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埃吉博士估计病毒是在几个月前开始在纽约地区传播的 。

西奈山的研究人员开始对进入医院的患者进行基因组测序 。 他们发现 , 在纽约发现的最早的病例与之后的病例没有关联 。

“两周后 , 我们开始看到相关联的病毒 , ”西奈山团队成员冈萨雷斯·赖希博士说 。

冈萨雷斯·赖希博士和她的同事发现 , 这些病毒实际上与欧洲各地的病毒相同 。 他们无法说哪一个特定病毒来自于哪一个特定的航班到达纽约 。 但是他们写道 ,


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