『』我们能利用现有的药物和网络终结COVID-19么?
2020年2月26日讯 /生物谷BIOON /——一种疫苗可能至少需要一年的时间 。一种新药可能需要十年才能问世 。即使全世界的资源都集中在一种新的疾病上 , 也很难从零开始创造新的治疗方法 。然而 , 将现有药物用于其他情况可能提供急需的捷径 。
从实验室的测试到被批准的广泛使用 ,药物平均需要12年 。在监管机构可以确信它不会造成不成比例的副作用之前 , 需要许多专家、许多时间和许多经费来创建、优化和测试一个分子 。
有了现有的药物 , 科学家可以跳过许多早期步骤 , 开始对患者进行测试 , 只要有证据表明它可能对患者有益就行 。
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图片来源:Rawpixel licenced under CC0
可能这些药物已经上市了 , 或者在研发过程中被弃用了 , 因为它们没有达到最初的目的 , 但已经通过了安全试验 。
一种药物在其他领域有意想不到的好处是很正常的 。最著名的例子是伟哥 , 它最初是用来治疗心血管疾病的 。
在集中医药柜中有超过一万名这样的候选药物 , 在人体中测试所有这些药物显然是不可能的 。然而 , 一台超级计算机实际上可以在一眨眼的时间里测试每一种药物 。
意大利米兰理工大学教授Cristina Silvano说:"我们非常有信心 , 因为我们已经在寨卡病毒的案例中应用了这种方法 。"
她是一个名为ANTAREX的项目的协调人 , 该项目已经开发出了从超级计算机中提取更多计算能力的方法 , 方法是针对所有组件(如处理器和内存存储)优化软件 。
"我们称它为调优 , 因为我们正试图专门针对超级计算机的硬件架构对软件应用程序进行调优 , 以获得更快的处理速度和最佳的精度 。"
他们选择了一个测试案例来演示超级计算机的能力 , 这个测试案例就是模拟筛选潜在的药物 。以寨卡病毒为例 , 他们实际上筛选了超过10亿种化合物 , 并确定了一些目前正在巴西实验室进行测试的化合物 。
该平台目前正用于Exscalate4CoV项目 , 以寻找能够附着在新型冠状病毒蛋白质上的分子 , 并阻止其发挥作用 。要做到这一点 , 软件需要知道病毒蛋白质的样子以及它的结构 , 这样它就可以看到化合物是如何附着的 , 就像拼图的碎片一样 。
幸运的是 , 世界各地的科学家正在迅速识别冠状病毒的蛋白质结构 。
"还会有更多 , 几乎每天或者至少每周都有 。"Dompe制药公司的Andrea Beccari博士说道 , 他管理着药物发现平台 。
安全标准
为了尽快做出改变 , 他们已经将注意力集中在已经通过人体试验安全标准的分子上--总共大约有10000个 。这些分子可能是现有的治疗其他疾病的药物 , 也可能从来没有公开提供过 , 因为它们的效力不足以达到最初的目的 。
科学家们可以很快开始在COVID-19患者身上测试这些潜在的药物 , 而不需要在动物和健康人身上进行几轮的安全测试 。
Beccari博士说:"我们认为我们可以给社区提供最多的是通过寻找不被称为抗病毒药的分子 , 但将是专门针对冠状病毒的抗病毒药 。"
该软件已经识别出了一些潜在的候选药物 , 但它们仍然需要在实验室中进行测试 , 以选择最有希望的 。
"我们用这些方法选择了近100个分子 , 目前这些分子正在我们位于比利时鲁汶的设施中接受生物学评估 。所以我们的计划是 , 在两到三周内 , 我们的模拟结果应该会得到实验结果的证实 。"
超级计算机虚拟筛选的结果可能有助于找到以前没人想过可以测试这种新型冠状病毒的药物 。然而 , 科学家们怀疑 , 有几种现有的治疗其他疾病的方法可能有效 , 现在 , 在最初为应对抗菌素耐药性而建立的网络的帮助下 , 这些方法正在COVID-19患者中迅速进行测试 。
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