厉害了!基因编辑实现光控( 二 )
“我们试验了各种方案 , 但整个系统的运行却都失败了 。 ”叶海峰说 , 这个结果意味着需要对策略进行根本性的调整 。
直到有一天 , 叶海峰在《自然》子刊(Nature Biotechnology)上看到一篇张锋(基因编辑技术发明人之一)的文章 , 上面说基因编辑的Cas9蛋白可以一拆而二 , 拆开来之后的两半再合起来也是有功能的 。
“受到这样的启发 , 我们就想我们可不可以就把它拆成两半 , 一半是连续的强表达(自始至终一直表达) , 另一半用光驱动调控来表达 。 ”叶海峰说 , 就像“钥匙”的两半拼在一起才能开锁一样 。
“拼”这个动作又要怎么自动实现呢?叶海峰想到了热纤维梭菌中的一对能够自发相互结合的蛋白Coh2和DocS 。 让它们加入进来 , 分别与Cas9的两部分融合 , Coh2和DocS就会像“磁石”一样 , 将Cas9的两部分拼装成完整、有功能的完整Cas9核酸酶 。 
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“究竟是哪一半用光来调控诱导表达 , 都是有说法的 。 ”叶海峰回忆 , 课题组对多种情况进行了试验 , 至少进行了上百种不同序列的验证 , 以寻找最佳光控基因编辑效果 。
“我们还对整个系统进行了优化 , 例如质粒的浓度配比 , 核输入信号和核输出信号的选择及组合等 , 并在细胞水平进行了测试 。 ”叶海峰说 , 经过严谨的优化 , 实验结果最终令人满意 , 并将其命名为“FAST系统” 。
研究结果显示 , FAST系统在LED发射的低强度远红光照射下可以诱导细胞内的基因编辑 , 而在黑暗情况下保持“静默”的效果也很好 。
进一步地研究表明 , FAST系统在多种细胞中均显示出可调控的基因编辑效果 , 并具有很好的光照强度和时间依赖性 , 以及高度的时空特异性 , 为研究FAST系统在动物体内的可调控基因编辑能力奠定了基础 。
“我们至今也不太清楚为什么直接调控表达完整Cas9核酸酶的系统不成功 。 ”叶海峰说 , 不按程序走 , 这就是生命科学的神奇之处 , 而合成生物学正是在破解这些意外中积累起来 , 最终解决更大的科学命题 。
FAST系统“打怪升级”
走进肿瘤BOSS不简单
生命体是复杂的 , 在细胞水平运转良好的系统在活体中能不能工作 , 仍面临着重重挑战 。 为此 , 在进行了细胞验证后 , 研究者还进行了转基因报告模型小鼠和肿瘤模型小鼠的验证工作 。
“让整个系统在活体中工作 , 会遇到新的问题 , 比如递送的问题 。 ”叶海峰解释 , FAST系统由好几个质粒组成 , 它们进入细胞比较简单 , 但能不能突破重重阻碍进入到组织细胞里面呢?比如怎么高效递送到肝脏里面 , 怎么高效的递送到肿瘤组织里面 , 这就需要借助于递送系统 , 而且递送的效率直接决定整个系统的工作效率 。
“研究推进时 , 递送技术是又一个难题 , 我们最初直接通过静脉注射 , 效果却不是那么好 。 ”叶海峰说 , “细胞中工作的质粒在进入活体的时候受到了阻碍 , 因为整个系统承载的元件太多 , 所有元件同时递送的效率不能保证 , 且质粒会被机体认为是外来物而被清除掉 。 ”
想进入活体 , 整个系统还需要再调整 。 “这就好比原来坐的卡车太大了、目标明显 , 需要换乘一个‘特洛伊木马’潜进去 。 ”叶海峰说 。 
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研究团队后来在伙伴团队的帮助下 , 使用另一种更小的、并能够整合进细胞里的质粒进行系统的递送工作 。 实验结果中 , 转基因报告的小鼠在肝脏部位显示出了基因编辑的报告情况 , 表明小鼠肝脏细胞中DNA可通过光控编辑 。
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