东方网|血液中的肿瘤“信号”可以“早发现”！复旦大学科研团队发布最新研究成果
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东方网采访人员傅文婧7月22日报道：当前 ， 恶性肿瘤的发病率和死亡率呈逐年上升的趋势 ， 已成为全球人类主要的疾病负担之一 。 与早期肿瘤相比 ， 晚期肿瘤平均5年生存率仅为26% ， 而早期肿瘤患者的5年生存率可达91% ， 因此 ， 实现肿瘤的“早发现” ， 可帮助患者赢得治疗时间 ， 有效提高治愈率 。
北京时间7月21日晚 ， 《自然·通讯》（Nature Communication）发表了由复旦大学泰州健康科学研究院和人类表型组研究院科研团队的成果《血液无创检测可以比常规诊断提前四年发现癌症》（“Non-invasive early detection of cancer four years before conventional diagnosis using a blood test”） 。 这一最新研究成果证实了通过提高检测技术的灵敏度能够更早的发现肿瘤标志物 ， 从而实现有效的对癌症早期筛查 ， 具有重要的科研与健康意义 。
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据悉 ， 该团队由青年研究员陈兴栋等领衔 ， 对复旦大学牵头建设的泰州队列的部分血液样本进行了长期、系统的癌症早期检测研究 。 研究发现 ， 对于结直肠癌、食管癌、肝癌、肺癌和胃癌等5种常见恶性肿瘤 ， 在达到现有临床确诊金标准之前 ， 甚至在病人出现自觉症状前 ， 早期的癌症信号——微量肿瘤甲基化就存在于血液循环之中 ， 并可以被无创检测 。 利用由复旦校友企业鹍远基因原创研发的ctDNA甲基化多癌筛查技术PanSeer方法 ， 陈兴栋团队在泰州队列的血样中实现了比临床诊断提前4年发现血液中的微量肿瘤甲基化信号 。
与早期肿瘤相比 ， 晚期肿瘤由于不能通过手术切除 ， 缺乏有效的治疗方案 ， 平均5年生存率仅为26% ， 而早期肿瘤患者的5年生存率可达91% 。 因此 ， 实现肿瘤的“早发现” ， 可帮助患者赢得治疗时间 ， 有效提高治愈率 。 但是 ， 要对早期肿瘤检测和筛查进行验证和研究 ， 不仅仅需要高效、灵敏的技术 ， 更关键的是需要对肿瘤患者在确诊前即进行血液和生物样本采样 。 这就决定了 ， 基于已有的肿瘤医院确诊病例样本库无法严格证明一个新早期筛查技术能够超越当前的临床标准 。 此时 ， 就需要有大型、长期开展科研活动的人群队列来支撑科学家们的探索活动 。
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泰州队列由复旦大学牵头 ， 于2007年开始建设 。 截止目前 ， 已有近20万社区人群参加该项研究 。 研究团队通过系统的队列随访 ， 长期跟踪队列人群各种重大慢性病的发生情况 ， 并且在无症状人群中于多个时间节点跟踪采集了150余万份各类生物样本长期保存 。 此次发表的研究成果 ， 纳入了191个在采样时间点1-4年后确诊肿瘤的病人血液样本 ， 和223个在当地医院确诊后采集的肿瘤病人血样 ， 并遵循严格的1:1匹配原则 ， 选取414个随访超过10年且未被诊断为肿瘤的病人样本作为对照人群 。
开展研究的过程中 ， 校企科研团队融合生命科学和大数据科学多学科手段 ， 基于ctDNA甲基化特质设计了一套机器学习方法 。 为严格控制大数据分析中常见的过拟合隐患 ， 研究团队采用计算样本中每个靶基因组区域的平均甲基化水平和集合logistic回归（LR）分类器的组合 ， 并充分考虑大量的干扰因素 ， 以完成区分健康患者与癌症患者的分类模型搭建 。 该分类器在训练集中的特异性为94.7% ， 对确诊后采集的病人样本以及未确诊之前采集的样本分别达到88% 和91% 的敏感性 。 在一个独立的测试样本集中 ， 研究团队在207个健康对照样本重现96%的特异性的前提下 ， 在113个确诊后采集的病人样本上达到了88%的敏感性 。 接下来 ， 在98名未确诊之前1-4年采集的样本中PanSeer技术达到了95%的检测敏感性 。
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