让基因编辑脱靶无处躲藏( 五 )

理想很美好 , 现实很残酷 。 如何提升检测脱靶效应的精度?答案是:彻底颠覆原有的脱靶检测手段 。

为实现这一目标 , 杨辉研究组与合作者建立了一种名叫“GOTI”的脱靶检测技术 。 研究者们在小鼠受精卵分裂到二细胞期的时候 , 编辑一个卵裂球 , 并使用红色荧光蛋白将其标记 。 当小鼠胚胎发育到14.5天时 , 将整个小鼠胚胎消化成为单细胞 , 再利用细胞分选技术 , 基于红色荧光蛋白分选出基因编辑细胞和没有基因编辑的细胞 , 并进行全基因组测序 , 比较两组差异 。 这样就避免了单细胞体外扩增带来的噪音问题 。

“由于实验组和对照组来自同一枚受精卵 , 理论上基因背景完全一致 。 因此 , 直接比对两组细胞的基因组 , 其中的差异基本就可以认定是由基因编辑工具造成的 。 这样便能发现此前脱靶检测手段无法发现的完全随机的脱靶位点 。 ”该课题合作开发者、中国农业科学院深圳农业基因组研究所研究员左二伟解释 。


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