华南海鲜市场不是病毒源头！最新研究( 二 )

值得注意的是，与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是 H1 及其衍生单倍型，而一份来自武汉样品的更“古老的”单倍型 H3 则与华南海鲜市场无关。作者结合第一批患者报告信息，以及种群扩张时间分析结果，作者推测华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来，在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。

作者还推测，单倍型 H13 和 H38 通过一个中间载体与蝙蝠冠状病毒 RaTG13 关联，这个中间载体 mv1 可能是一个祖先单倍型，也可能来自中间宿主或者“零号病人” 。

“古老的”单倍型 H13 和 H38 的病毒样品分别来自深圳的病患（广东首例）和美国华盛顿州的病患（美国首例）。他们的旅行记录表明 2019 年 12 月底至 2020 年 1 月初都来过武汉。

为什么有 2 个“古老的”单倍型呢？郁文彬对 DeepTech 解释说，其实 H13 和 H38 ，以及 H3 ，它们两两之间只有 1 个核苷酸位点的差异，有可能是衍生到 H3 后，发生了一次转换的回复突变，衍生到另外一种基因型基因型。并且两者都是同义突变，即该突变不影响基因表达的结果。这就意味着 2 个“古老的”单倍型极为接近。

现有武汉样本中没有检测到 H13 和 H38 单倍型，作者推测可能是因为现有样品主要采自几家定点医院，而且样品采集时间局限于 2019 年 12 月 24 日和 2020 年 1 月 5 日。那么，如果能在武汉其他医院早期的病患中检测到这两种单倍型，将对于寻找病毒来源非常有帮助。

对于单倍型 H3 ，其武汉样本的发现时间在 2020 年 1 月，但这并不意味着其基因型更“年轻” 。郁文彬解释说，可能是因为病毒在被传染到这位携带者身上没有发生变异，或者很早传染到这位患者，只是没有发病。

追踪“零号病人”

图 | 新型冠状病毒单倍型的样品采集时间情况。红色圈的样品是确认与华南海鲜市场有关；蓝色圈的样本确认与海鲜市场无关（来源：郁文彬）

华中农业大学一位匿名教授评价说，这是一项基于现有新型冠状病毒基因组序列的研究。理论上根据其变异的情况，是能够溯源各个样本之间的关系，到底是父子关系还是兄弟姐妹关系，到底复制了多少代。那么就可以最终追溯出最早的新冠病毒从哪里来。当然这里有一个假设是病毒是从动物传播到人。

在华南海鲜市场之外发现单倍型 H3 也就意味着， H3 携带者传染了去华南海鲜市场的人，结果将人流拥挤的华南海鲜市场变成了病毒传播爆发点。

他认为，溯源很重要，这个研究是通过大数据分析的，非常有意义。最核心的调查是最早感染新冠病毒的那几个人，这尤其需要医院配合，但是医院可能现在没心思、没精力来做这件事，那些医生可能也没有进化基因组学的背景，所以他们也可能没有认识到这件事的价值。

他说，至于这个最原始的携带者，也就是“零号病人” ，可能是接触蝙蝠的人。理论上还是能够追溯的，即使零号病人已经去世，在某个医院应该还保留了他的血液样本。

郁文彬认为，最原始的单倍型不太可能存在现在的患者身上，因为病毒的变异太快。他们现在能拿到的数据已经是最早是 12 月 24 日，因为没有早期的样本就很难去溯源， “我们猜测国内医院可能没有保存早期患者的组织材料，当然我们非常希望有早期的样品存在” 。