华南海鲜市场不是病毒源头!最新研究( 三 )
郁文彬表示 , 这个研究有个不足 , 那就是 93 个样本中 , 武汉样本主要是早期的 , 如果有更多武汉样本进行基因组测序的话 , 可能在溯源方面可以找到更多的证据 , 比如说找到 H13 和 H38 单倍型 , 可能可以帮助找到病毒来源 。
一个好消息
郁文彬说 , 这项研究主旨是分析整个新冠病毒基因组的变异情况 , 以及弄清楚新冠病毒传播式样 , 基于传播和扩散的分析 , 为寻找病毒来源提供基因上的证据 。
研究人员发现新型冠状病毒基因组没有发生重组事件 , 93 个基因组之间有 120 核苷酸发生了突变(0.41% 序列长度) , 并均匀分散在 10 个编码区 。 120 个突变的核苷酸关联了 119 个氨基酸密码子 , 其中 79 个密码子(65.83%)改变了氨基酸类型 , 并有 42 个(53.17%)氨基酸理化性质都被改变 。
“新冠病毒基因组尚未发生重组事件”的结论是一个好消息 , 也就是说不会产生新的全新的病毒毒株 。
研究的另一个结论是 , 新冠病毒在 2 月 12 日之前发生过 2 次明显的种群扩张 。
根据新型冠状病毒基因组发生重组时间推算 , 1 月之前的种群扩张发生时间是 12 月 8 日 , 那么病毒可能在 12 月初 , 甚至 11 月下旬即已经开始有人际传播 , 随后在华南海鲜市场加快了人际传播 。
研究推算 2 月份之前的种群扩张时间在 1 月 6 日 , 这个可能与元旦假期有关联 。 需要指出 , 此时国家疾控中心发布了 2 级应急响应 。
研究团队认为 , 当时的预警起到了一些警示作用 , 公众活动和出行都有所减少 。 如果当时的警示能引起大众更广泛的重视 , 那么 1 月份中下旬向全国和全球蔓延的病例会有所降低 。
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参考:链接
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DeepTech深科技02-22 15:30
华南海鲜市场的新冠病毒来自其他地方 , 这个结论有了基于基因序列的证据 。
中国科学院西双版纳热带植物园的研究人员在分析 93 个新型冠状病毒样本基因组数据后发现 , 基于 120 个变异位点得到 58 种单倍型(基因类型)中 , 来自华南海鲜市场患者样品单倍型与 H1 有关 , 而作为更古老的基因类型样本 H3、H13 和 H38 则来自华南海鲜市场之外 。 这印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论 。
新型冠状病毒 58 种单倍型的演化关系和地理分布格局(A , B) , 单倍型之间的可能演化关系(C) , 以及新型冠状病毒的可能传播和扩散路线(D);A 和 B 圆圈中的数据是样本数量(来源:郁文彬)
这个研究印证了此前 1 月 24 日发表在《柳叶刀》的研究结论 , 即追踪第一批 41 个确诊病例发现 , 这批最早在 12 月 1 日报告的病例中 , 总共有 13 个病例与海鲜市场无接触史 。 也就是说 , 病毒在进入海鲜市场之前就已经潜入武汉居民的生活中 。
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