「病毒」新冠病毒发生基因突变,发源地、宿主仍待明确( 二 )


国家卫健委2月29日发布的《中国-世界卫生组织新型冠状病毒肺炎(COVID-19)联合考察报告》显示 , 新型冠状病毒具有冠状病毒家族的典型特征 , 属于β-冠状病毒 。
上述报告指出 , 对新冠病毒的全基因组序列和已有的其他β-冠状病毒的全基因组序列进行一致性比对后显示 , 该病毒与蝙蝠携带的SARS样冠状病毒RaTG13株全基因组亲缘关系最近 , 同源性为96% 。 此亦为中国科学院武汉病毒研究所研究员石正丽团队的研究结论 。 相关论文1月末已发布在bioRxiv预印版平台 , 2月初《自然》杂志收稿、在线发布 。
《柳叶刀》1月30日在线发表的中疾控研究团队论文 , 也认为新冠病毒的原始宿主可能是蝙蝠 , 中间宿主未明 。 虽然另有研究称穿山甲或是潜在的中间宿主 , 但目前仍不能确定 。
上述中国与世卫组织联合考察报告也强调 , 新冠病毒是一种动物源性病毒 。 目前的全基因组基因序列系统进化分析结果显示 , 蝙蝠似乎是该病毒的宿主 , 但中间宿主尚未查明 。 该报告附件中还称 , 对病毒的动物来源和天然宿主、初始阶段动物到人的感染过程、早期暴露史不详的病例等传染源方面的问题仍存知识局限 。
而找到人类感染的直接源头与动物宿主 , 才能从根本上切断传染源与传播链 。 此前 , 香港大学新发传染性疾病国家重点实验室深圳分室副主任朱华晨 , 接受新京报采访人员采访时曾如此分析 。
冠状病毒是正链RNA病毒 , 易于发生突变与重组 。 世卫组织总干事谭德塞1月下旬亦曾提醒 , 防控工作还要考虑病毒随时可能出现的基因突变 。
3月3日 , 科学出版社出版的综合性英文学术期刊《国家科学评论》(National Science Review) , 刊发了论文《关于新冠病毒的起源和持续进化》 , 来自北京大学生命科学学院生物信息中心等科研机构的研究人员 , 通过对103株新冠病毒基因组的群体遗传学分析 , 发现新冠病毒演化出两种主要类型(L型和S型) 。 武汉市疫情暴发初期以L型流行为主 , 2020年1月初以后L型流行频率下降 。 此外 , 研究团队共在103株测序毒株的149个位点发现了突变 。
「病毒」新冠病毒发生基因突变,发源地、宿主仍待明确
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刊发在《国家科学评论》(National Science Review)的论文《关于新冠病毒的起源和持续进化》 。 网页截图
对此 , 朱华晨向新京报采访人员分析 , 不是说所有突变点都集中于一株病毒 , 而是说已知的103株病毒凡有不同的位点 , 统统罗列出来 , 共有149个位点不同 。 这意味着 , 新冠病毒发生了基因序列突变 , 但变异并不算大 。 “这在RNA病毒复制、演化上属于比较正常的现象 。 ”很多突变可能没有生物学意义 , 也就是说未必会明显改变病毒的功能与行为 。
但她强调 , 也不能轻视病毒的变异 , 因为冠状病毒是正链RNA病毒 , 易于发生突变与重组 , 要密切留意关键基因位点上的变化 , 持续监测病毒的演化方式 , 并警惕这些突变可能产生的病毒表型和行为的变化 。 比如 , 对人体的致病性、影响的器官部位、排毒的时间、途径 , 还有传播能力的改变等 , 都需要重点关注 。
去年12月中旬已发生人际传播 , 存在无症状感染者
1月20日 , 国家卫健委高级别专家组组长、中国工程院院士钟南山公开表示 , 根据目前的资料 , 可以证实新冠病毒存在人传人现象 。 他介绍 , 广东有2个病例 , 没去过武汉 , 但家人去过武汉后染上了新冠肺炎 。
同日晚间 , 广东珠海市卫生健康局披露了一起家庭聚集性病例 。 父母亲于1月11日自武汉乘坐高铁到珠海女儿家 , 1月15日父亲感到不适就诊 , 1月17日初步诊断为新冠肺炎疑似病例 , 母亲及女儿也先后出现发热等症状 , 后均确诊 。
就在当天早些时候(1月20日凌晨2时许) , 广东省卫健委在官网披露 , 国家卫健委前一日确认该省首例新冠肺炎确诊病例 。 患者是家住深圳的66岁男性 , 2019年12月29日曾到武汉探亲 。 根据深圳市卫健委后来披露的信息 , 这也是一起家庭聚集性病例 。 该男子与妻子、女婿、外孙等从武汉探亲返深后 , 没去过武汉的亲家母也感染了 。
《柳叶刀》1月24日在线发表的一篇家庭聚集性病例研究论文中 , 香港大学李嘉诚医学院微生物学系、香港大学深圳医院临床微生物及感染控制科研究人员详细分析了上述深圳病例 。 在前往武汉的6名家属中 , 有5人被确认感染了新冠病毒 。 在武汉期间 , 这6名家庭成员都没有接触过动物 , 也没有去过包括华南海鲜市场在内的市场 。 但有2人去过武汉一家医院 , 探望因高热性肺炎住院的亲属 。
「病毒」新冠病毒发生基因突变,发源地、宿主仍待明确
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有武汉旅行史的返深圳家庭中 , 多名家庭成员呈现肺部多发磨玻璃样改变 , 其中10岁的患者为无症状感染者 。 论文截图
一家人返回深圳后 , 女儿、女婿及孩子和亲家母住在一起 。 1月8日 , 亲家母出现背痛、全身无力等症状 , 在当地一医院接受头孢克洛治疗后无好转 , 并出现发烧、干咳等症状 , 于1月11日再次就诊 。 而她在过去14天内并未去过武汉或深圳市场 , 后确诊新冠肺炎 。


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